Toonkunstkoor Bekker werd in 1877 opgericht door de dirigent van de toenmalige Groninger Orkest Vereniging, de heer J.H. Bekker (foto rechts), als concertkoor van het orkest. Het koor stond algemeen bekend als het koor van Bekker en heeft deze naam vervolgens overgenomen.

Ook toen de Groninger Orkest Vereniging was opgegaan in het Noordelijk Filharmonisch Orkest waren de koordirigenten als regel ook vaste dirigenten van het orkest. Charles de Wolff was de laatste dirigent die beide functies in zich verenigde, van 1961 tot 1989.

Onder Charles de Wolff werkte Bekker mee aan grote projecten als het Te Deum van Van der Horst, Berlioz' Grande Messe des Morts en La Damnation de Faust en enkele opera's in concertante vorm, waaronder Boris Godoenow van Moessorgski en Otello van Verdi. Ook trad Bekker frequent op met uitvoeringen van Bachs Matthäus Passion en diens Johannes Passion alsook met Beethovens Negende Symfonie.

De Matthäus traditie is voortgezet onder Oane Wierdsma, die van 1992 tot 2007 als dirigent aan het koor verbonden was. Ook deze dirigent hield van een breed repertoire. Onder zijn leiding werden de laatste jaren onder meer werken uitgevoerd van Vaughan Williams, Honegger en Rutter. Een hoogtepunt in de rijke traditie was de samenwerking met het Crouch End Festival Chorus met uitvoeringen van Brittens War Requiem in Londen en Groningen (foto links). In 1996 verleende het koor haar medewerking aan de groots opgezette en succesvolle openluchtvoorstelling van de opera Norma van Bellini op de Grote Markt in Groningen.

Sinds februari 2008 is de jonge, veelbelovende dirigent Geert-Jan van Beijeren Bergen en Henegouwen de vaste dirigent van Toonkunstkoor Bekker.